min'stery

Ex vivo (Latin: out of the living) means that which takes place outside an organism. In science, ex vivo refers to experimentation done in or on living tissue in an artificial environment outside the organism. The most common "ex vivo" procedures involve living cells or tissues taken from an organism and cultured in a laboratory apparatus, usually under sterile conditions for a few days or weeks. The living cultured cells serve as models of the whole organism, reducing the need for vivisection. One widely performed ex vivo study is the chick chorioallontoic membrane (CAM) assay. In this assay, angiogenesis is promoted on the CAM membrane of a chick embryo outside the organism (chicken). Ex vivo studies are usually performed in vitro, although the use of these two words is not synonymous.

In vitro (Latin: (with)in the glass) refers to the technique of performing a given experiment in a test tube, or, generally, in a controlled environment outside a living organism. In vitro fertilization is a well-known example of this. Many experiments in cellular biology are conducted outside organisms or cells, thus, the conditions and, therefore, results may not correspond to those inside. Consequently, experimental results are often annotated with in vitro or its opposite in vivo as it applies.

from wikipedia

GFAP: Glial fibrillary acidic protein. The degenerative brain
condition called Alexander
disease is caused by mutation in GFAP (glial
fibrillary acidic protein).

The scid mutation was first described in 1983 in C.B-17 strain mice [22]. C.B-17 mice are BALB/c mice congenic at an immunoglobulin heavy chain locus derived from C57BL/Ka mice [27]. Recently, the catalytic subunit of a DNA-dependent protein kinase encoded by a gene termed "protein kinase, DNA activated catalytic polypeptide" (Prkdc) has been identified as the gene disrupted by the scid allele [28-32]. The Prkdc^scid gene encodes a nonsense mutation which causes the insertion of a termination codon [33].

^{[Concise Reviews}

SCID Mouse Models of Human Stem Cell Engraftment

Dale L. Greiner^a, Ruth Ann Hesselton^b, Leonard D. Shultz^c ]

文／高雄榮總血液腫瘤科主任　王玉祥


腫瘤細胞實際上皆由正常細胞轉變而成，腫瘤細胞異於正常細胞之處乃是有過度增生現象，並失去控制正常生長的机制，無分化成熟的能力，正常細胞代謝衰老死亡程式亦消失，故腫瘤實際是生長失控老不死的細胞群，此特性之來源乃來自細胞核內遺傳訊息的改變，可直接或間接促使正常細胞有上述異常變化者稱為癌原，癌原來自人類生活周遭的環境，主要有化學物、病毒、輻射、紫外線等，經由不同的途徑進入我們賴以為生的維生物內，如食物、空氣、水源、土壤中。

流式細胞儀（flow cytometer）是現代生物學研究不可或缺的利器，除了可鑑定細胞的標
記外，還可分析細胞的分裂週期、DNA 含量、細胞凋零死亡（apoptosis）、細胞內鈣離子的
濃度變化、pH 值之改變……等等。此外，流式細胞儀更可將細胞篩選出來，供進一步研究，
因此瞭解流式細胞儀的原理及用途，可為將來研究發展提供一個強而有力的利器。

蛋白質體的定義：

以以下三方面討論：

1.     
基本定義：蛋白質體（proteome）和蛋白質體學（proteomics）兩個字的由來，並比較傳統的蛋白質研究和現在的蛋白質體學有何不同。

2.     
蛋白質體和基因體：舉例說明蛋白質體和基因體包含的範圍。

3.     
研究蛋白質體學的重要性：蛋白質體學為什麼是繼基因體學後熱門的課題。

a product of cells of the immune system that may stimulate immunity and cause
the regression of some cancers.

--

Cytokines are a large group of molecules that regulate interactions in the
immune system. Cytokines are messengers that carry biochemical signals to
regulate local and systemic immune responses, inflammatory reactions, wound
healing, formation of blood cells, and many other biologic processes. More than
100 cytokines have been identified.

這實驗在書上看過

之前也看過別人做過

微生物之營養

微生物需藉攝取營養物質作為碳源及能量源，而經代謝作用所產生之能量運用於新細胞合成與支持生命。各種微生物生長繁殖所需之營養物成分則與本身之組成化合物相似，除此主要營殖所需之營養物成分則與本身之組成化合物相似，除此主要營養成分外，尚需一些微量元素，例如Mg、Zn、Cu等。

transition state適用什麼單位計算的?
答案是:10^-15秒...

阿~殘念~~~

(femtosecond spectroscopy。femto是10^-15，0.000,000,000,000,001， 有人翻成「毫微微」，也有音 譯為「飛」，這裡採用後者，把 femtosecond譯為「飛秒」，femtochemistry譯為「飛秒化學」，意指研究 數百飛秒內的化學變化細節。)

依研究內容來分，「基因體學」genomics著重基因的發現與鑑定，並標示出它們在染色體的排列位置;「蛋白質體學」proteomic為功能性基因體學的主流，著重於基因產物的功能分析—包括:基因產物之表現量、大規模蛋白質純化、鑑定與結構分析，並探討蛋白質之間的相互作用。蛋白質體學的終極目標是在蛋白質具有功能的環境下去分析各種蛋白質，並且從蛋白質多樣性的角度來了解複雜性疾病的起源，這將探討到生物化學及生理學上已知或未知的回饋反應、迴路、階梯反應以及訊息傳遞路徑。由基因體學及蛋白質體學產生的資料將遠遠超過所有各種傳統研究方法所得的結果，這些新興資料的儲存、分析與處理就是所謂的「生物資訊學」bioinfirmatic。

基因體學是蛋白質體學的源頭

質譜儀與生物資訊學的發展加速蛋白質體學的研究腳步

 蛋白質體學是醫學研究之另一利器

刺激 surveillance  system

1.在實際 stop codon 前出現突變的 stop codon

2.在 exon-intron 前出現 stop codon

本文回顧帶電複合粒子存在於電解質溶液中所進行的
沉降和電泳運動，而所謂的複合粒子，是由在固體粒子核
心的表面包覆一層多孔性物質所組成。在溶劑與離子皆可
自由穿透的多孔性表面層內，水力摩擦環節和固定電荷皆
為均勻分佈。對於一帶電複合粒子在電解質溶液中的運
動，可將主導離子濃度分佈、靜電位分佈和表面層內外流
體速度分佈之基本電動力方程式予以線性化。以複合粒子
之固體核心表面的電荷密度和多孔性表面層內的固定電荷
密度為二個微小擾動參數，應用正規微擾法來求解這些已
線性化之主導方程式，再藉平衡作用於複合粒子的重力、
靜電力和流體阻力等三種力後，可得到帶電球形複合粒子
的沉降速度及電泳可動度的解析形式表示式。研究結果顯
示，相對於不帶電之複合粒子，固定電荷的存在將減緩粒
子的沉降速度。應用電解質溶液中的離子電化學位能分
佈，可計算通過懸浮液之平均電流密度，進而得到懸浮液
中的沉降電位和有效電導度。分析結果顯示，懸浮液中的
沉降電位和粒子的電泳可動度相互滿足 Onsager 對比關係
式；相對於不帶電複合粒子之懸浮液的電導度，複合粒子
之固定電荷會導致對懸浮液電導度的加強或減弱，此強弱
效應與電解質溶液和複合粒子的特性有關。在固體粒子核
心與表面多孔性物質相對大小的極限情況下，帶電球形複
合粒子懸浮液中的沉降速度、沉降電位、電泳可動度、和
有效電導度的結果可蛻變為帶電球形固體粒子與多孔性粒
子懸浮液的相關解析解。